Активами основного целевого капитала «Уставная деятельность Северо-Восточного федерального университета им. М.К.Аммосова» с 2012 года доверено управлять АО «ААА Управление Активами». В качестве пионера в отрасли управления активами эндаументов управляющая компания объединяет пул старейших некоммерческих организаций отрасли.
АО «Управляющая компания Первая» с 2021 года управляет активами одного из целевых капиталов в результате закрытого конкурсного отбора.
Управляющая компания АО «РЕГИОН Эссет Менеджмент» с 2021 года управляет активами одного из целевых капиталов в результате закрытого конкурсного отбора.
«АО «ВИМ Инвестиции» — управляющая компания c 2002 года. Основными направлениями деятельности являются деятельность по управлению инвестиционными фондами, паевыми инвестиционными фондами и негосударственными пенсионными фондами.